Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC12A4Q9UP95 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC12A4Q9UP95 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms