Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PACSIN3Q9UKS6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms