Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TSR3Q9UJK0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms