Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCMF1Q9P0J7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms