Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EHD3Q9NZN3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EHD3Q9NZN3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms