Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DLL3Q9NYJ7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DLL3Q9NYJ7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms