Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms