Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CMTM6Q9NX76 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CMTM6Q9NX76 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CMTM6Q9NX76 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CMTM6Q9NX76 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CMTM6Q9NX76 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CMTM6Q9NX76 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CMTM6Q9NX76 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms