Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMBRD1Q9NUN5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms