Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EMILIN3Q9NT22 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
EMILIN3Q9NT22 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EMILIN3Q9NT22 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EMILIN3Q9NT22 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EMILIN3Q9NT22 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EMILIN3Q9NT22 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EMILIN3Q9NT22 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EMILIN3Q9NT22 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EMILIN3Q9NT22 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EMILIN3Q9NT22 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EMILIN3Q9NT22 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EMILIN3Q9NT22 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EMILIN3Q9NT22 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EMILIN3Q9NT22 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EMILIN3Q9NT22 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EMILIN3Q9NT22 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EMILIN3Q9NT22 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
EMILIN3Q9NT22 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EMILIN3Q9NT22 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EMILIN3Q9NT22 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EMILIN3Q9NT22 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EMILIN3Q9NT22 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EMILIN3Q9NT22 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EMILIN3Q9NT22 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EMILIN3Q9NT22 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EMILIN3Q9NT22 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EMILIN3Q9NT22 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EMILIN3Q9NT22 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EMILIN3Q9NT22 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms