Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP2Q9NS61 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms