Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX15Q9NRS6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms