Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
STRN4Q9NRL3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
STRN4Q9NRL3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
STRN4Q9NRL3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
STRN4Q9NRL3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
STRN4Q9NRL3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
STRN4Q9NRL3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
STRN4Q9NRL3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
STRN4Q9NRL3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
STRN4Q9NRL3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
STRN4Q9NRL3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
STRN4Q9NRL3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
STRN4Q9NRL3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
STRN4Q9NRL3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
STRN4Q9NRL3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
STRN4Q9NRL3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
STRN4Q9NRL3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
STRN4Q9NRL3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
STRN4Q9NRL3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
STRN4Q9NRL3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
STRN4Q9NRL3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
STRN4Q9NRL3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
STRN4Q9NRL3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
STRN4Q9NRL3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
STRN4Q9NRL3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
STRN4Q9NRL3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
STRN4Q9NRL3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
STRN4Q9NRL3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
STRN4Q9NRL3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
STRN4Q9NRL3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
STRN4Q9NRL3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
STRN4Q9NRL3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
STRN4Q9NRL3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
STRN4Q9NRL3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
STRN4Q9NRL3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
STRN4Q9NRL3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
STRN4Q9NRL3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
STRN4Q9NRL3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
STRN4Q9NRL3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
STRN4Q9NRL3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
STRN4Q9NRL3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
STRN4Q9NRL3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
STRN4Q9NRL3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms