Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MMP26Q9NRE1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
MMP26Q9NRE1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MMP26Q9NRE1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MMP26Q9NRE1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MMP26Q9NRE1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MMP26Q9NRE1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MMP26Q9NRE1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MMP26Q9NRE1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MMP26Q9NRE1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MMP26Q9NRE1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MMP26Q9NRE1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MMP26Q9NRE1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MMP26Q9NRE1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MMP26Q9NRE1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MMP26Q9NRE1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MMP26Q9NRE1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MMP26Q9NRE1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MMP26Q9NRE1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MMP26Q9NRE1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MMP26Q9NRE1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MMP26Q9NRE1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MMP26Q9NRE1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MMP26Q9NRE1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MMP26Q9NRE1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MMP26Q9NRE1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MMP26Q9NRE1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MMP26Q9NRE1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MMP26Q9NRE1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MMP26Q9NRE1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MMP26Q9NRE1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MMP26Q9NRE1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MMP26Q9NRE1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MMP26Q9NRE1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MMP26Q9NRE1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MMP26Q9NRE1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MMP26Q9NRE1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MMP26Q9NRE1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MMP26Q9NRE1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MMP26Q9NRE1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MMP26Q9NRE1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MMP26Q9NRE1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MMP26Q9NRE1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MMP26Q9NRE1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MMP26Q9NRE1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms