Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms