Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBH1

PDF, Peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDFQ9HBH1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDFQ9HBH1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDFQ9HBH1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms