Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Y6

POLR1B, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1BQ9H9Y6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.32■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.32■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.3■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.29■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.29■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.29■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.28■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.27■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR1BQ9H9Y6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
POLR1BQ9H9Y6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
POLR1BQ9H9Y6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
POLR1BQ9H9Y6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1BQ9H9Y6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1BQ9H9Y6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1BQ9H9Y6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1BQ9H9Y6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1BQ9H9Y6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1BQ9H9Y6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1BQ9H9Y6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1BQ9H9Y6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR1BQ9H9Y6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms