Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TDRD3Q9H7E2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TDRD3Q9H7E2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TDRD3Q9H7E2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TDRD3Q9H7E2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TDRD3Q9H7E2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TDRD3Q9H7E2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TDRD3Q9H7E2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TDRD3Q9H7E2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TDRD3Q9H7E2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TDRD3Q9H7E2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TDRD3Q9H7E2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TDRD3Q9H7E2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TDRD3Q9H7E2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TDRD3Q9H7E2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TDRD3Q9H7E2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TDRD3Q9H7E2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TDRD3Q9H7E2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TDRD3Q9H7E2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TDRD3Q9H7E2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TDRD3Q9H7E2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TDRD3Q9H7E2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TDRD3Q9H7E2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TDRD3Q9H7E2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TDRD3Q9H7E2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TDRD3Q9H7E2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TDRD3Q9H7E2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TDRD3Q9H7E2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TDRD3Q9H7E2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TDRD3Q9H7E2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TDRD3Q9H7E2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TDRD3Q9H7E2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TDRD3Q9H7E2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TDRD3Q9H7E2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TDRD3Q9H7E2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TDRD3Q9H7E2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TDRD3Q9H7E2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TDRD3Q9H7E2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TDRD3Q9H7E2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TDRD3Q9H7E2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TDRD3Q9H7E2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TDRD3Q9H7E2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TDRD3Q9H7E2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TDRD3Q9H7E2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TDRD3Q9H7E2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms