Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms