Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ACTR3CQ9C0K3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTR3CQ9C0K3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTR3CQ9C0K3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTR3CQ9C0K3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTR3CQ9C0K3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTR3CQ9C0K3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTR3CQ9C0K3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTR3CQ9C0K3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTR3CQ9C0K3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTR3CQ9C0K3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTR3CQ9C0K3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTR3CQ9C0K3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTR3CQ9C0K3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTR3CQ9C0K3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTR3CQ9C0K3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTR3CQ9C0K3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTR3CQ9C0K3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTR3CQ9C0K3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTR3CQ9C0K3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR3CQ9C0K3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR3CQ9C0K3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR3CQ9C0K3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR3CQ9C0K3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR3CQ9C0K3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR3CQ9C0K3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR3CQ9C0K3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR3CQ9C0K3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTR3CQ9C0K3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTR3CQ9C0K3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTR3CQ9C0K3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTR3CQ9C0K3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTR3CQ9C0K3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTR3CQ9C0K3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTR3CQ9C0K3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTR3CQ9C0K3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTR3CQ9C0K3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms