Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I9

LRRC27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC27Q9C0I9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRC27Q9C0I9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC27Q9C0I9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms