Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA4CQ9C0C4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA4CQ9C0C4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA4CQ9C0C4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA4CQ9C0C4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA4CQ9C0C4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA4CQ9C0C4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA4CQ9C0C4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA4CQ9C0C4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA4CQ9C0C4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA4CQ9C0C4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA4CQ9C0C4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA4CQ9C0C4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA4CQ9C0C4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA4CQ9C0C4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA4CQ9C0C4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA4CQ9C0C4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA4CQ9C0C4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA4CQ9C0C4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA4CQ9C0C4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA4CQ9C0C4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA4CQ9C0C4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA4CQ9C0C4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA4CQ9C0C4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA4CQ9C0C4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA4CQ9C0C4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4CQ9C0C4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms