Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT23Q9C075 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT23Q9C075 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms