Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXP3Q9BZS1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms