Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NDUFAF3Q9BU61 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms