Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP3BQ9BS92 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms