Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
PMCHL2Q9BQD1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PMCHL2Q9BQD1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms