Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN18Q99952 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN18Q99952 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN18Q99952 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN18Q99952 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN18Q99952 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN18Q99952 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN18Q99952 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN18Q99952 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN18Q99952 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN18Q99952 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN18Q99952 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN18Q99952 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN18Q99952 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN18Q99952 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN18Q99952 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN18Q99952 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN18Q99952 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN18Q99952 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN18Q99952 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN18Q99952 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN18Q99952 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN18Q99952 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN18Q99952 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN18Q99952 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN18Q99952 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN18Q99952 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN18Q99952 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN18Q99952 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN18Q99952 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN18Q99952 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN18Q99952 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN18Q99952 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN18Q99952 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN18Q99952 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN18Q99952 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN18Q99952 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN18Q99952 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN18Q99952 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN18Q99952 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN18Q99952 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN18Q99952 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN18Q99952 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN18Q99952 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN18Q99952 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN18Q99952 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN18Q99952 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN18Q99952 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPN18Q99952 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPN18Q99952 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPN18Q99952 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPN18Q99952 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms