Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UHRF1Q96T88 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UHRF1Q96T88 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UHRF1Q96T88 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UHRF1Q96T88 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UHRF1Q96T88 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UHRF1Q96T88 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UHRF1Q96T88 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
UHRF1Q96T88 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UHRF1Q96T88 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UHRF1Q96T88 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UHRF1Q96T88 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UHRF1Q96T88 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UHRF1Q96T88 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UHRF1Q96T88 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
UHRF1Q96T88 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UHRF1Q96T88 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UHRF1Q96T88 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UHRF1Q96T88 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UHRF1Q96T88 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UHRF1Q96T88 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UHRF1Q96T88 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UHRF1Q96T88 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UHRF1Q96T88 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UHRF1Q96T88 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UHRF1Q96T88 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UHRF1Q96T88 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UHRF1Q96T88 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UHRF1Q96T88 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UHRF1Q96T88 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UHRF1Q96T88 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UHRF1Q96T88 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UHRF1Q96T88 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UHRF1Q96T88 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UHRF1Q96T88 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UHRF1Q96T88 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UHRF1Q96T88 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UHRF1Q96T88 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UHRF1Q96T88 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UHRF1Q96T88 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
UHRF1Q96T88 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
UHRF1Q96T88 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms