Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE6

ZIM3, Zinc finger imprinted 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIM3Q96PE6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms