Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
YTHDC1Q96MU7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
YTHDC1Q96MU7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
YTHDC1Q96MU7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
YTHDC1Q96MU7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
YTHDC1Q96MU7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
YTHDC1Q96MU7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
YTHDC1Q96MU7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
YTHDC1Q96MU7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
YTHDC1Q96MU7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
YTHDC1Q96MU7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
YTHDC1Q96MU7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
YTHDC1Q96MU7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
YTHDC1Q96MU7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
YTHDC1Q96MU7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
YTHDC1Q96MU7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
YTHDC1Q96MU7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
YTHDC1Q96MU7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
YTHDC1Q96MU7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
YTHDC1Q96MU7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
YTHDC1Q96MU7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
YTHDC1Q96MU7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
YTHDC1Q96MU7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
YTHDC1Q96MU7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
YTHDC1Q96MU7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
YTHDC1Q96MU7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
YTHDC1Q96MU7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
YTHDC1Q96MU7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
YTHDC1Q96MU7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
YTHDC1Q96MU7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
YTHDC1Q96MU7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
YTHDC1Q96MU7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
YTHDC1Q96MU7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
YTHDC1Q96MU7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
YTHDC1Q96MU7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms