Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF0

Putative uncharacterized protein LOC100506887, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q96MF0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q96MF0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q96MF0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q96MF0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q96MF0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q96MF0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q96MF0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q96MF0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q96MF0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q96MF0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q96MF0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q96MF0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q96MF0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q96MF0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q96MF0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q96MF0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q96MF0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q96MF0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Q96MF0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q96MF0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q96MF0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q96MF0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q96MF0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q96MF0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q96MF0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q96MF0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q96MF0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q96MF0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q96MF0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q96MF0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q96MF0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q96MF0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q96MF0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Q96MF0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q96MF0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q96MF0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q96MF0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q96MF0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q96MF0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q96MF0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q96MF0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q96MF0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q96MF0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q96MF0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q96MF0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q96MF0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q96MF0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q96MF0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q96MF0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q96MF0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q96MF0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q96MF0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q96MF0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q96MF0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q96MF0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q96MF0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q96MF0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Q96MF0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q96MF0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q96MF0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q96MF0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q96MF0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q96MF0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q96MF0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q96MF0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q96MF0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q96MF0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q96MF0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q96MF0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q96MF0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q96MF0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q96MF0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q96MF0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q96MF0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q96MF0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q96MF0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q96MF0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q96MF0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q96MF0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q96MF0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q96MF0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q96MF0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q96MF0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Q96MF0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q96MF0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q96MF0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q96MF0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q96MF0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q96MF0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q96MF0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q96MF0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q96MF0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q96MF0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q96MF0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q96MF0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q96MF0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q96MF0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q96MF0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q96MF0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q96MF0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms