Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB6

LOXL4, Lysyl oxidase homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL4Q96JB6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LOXL4Q96JB6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LOXL4Q96JB6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LOXL4Q96JB6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LOXL4Q96JB6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LOXL4Q96JB6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LOXL4Q96JB6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LOXL4Q96JB6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LOXL4Q96JB6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LOXL4Q96JB6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms