Protein–RNA interactions for Protein: Q96HF1

SFRP2, Secreted frizzled-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP2Q96HF1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFRP2Q96HF1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms