Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC10A4Q96EP9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC10A4Q96EP9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms