Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFHD2Q96C19 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
EFHD2Q96C19 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFHD2Q96C19 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFHD2Q96C19 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFHD2Q96C19 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFHD2Q96C19 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFHD2Q96C19 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFHD2Q96C19 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFHD2Q96C19 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFHD2Q96C19 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFHD2Q96C19 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EFHD2Q96C19 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFHD2Q96C19 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EFHD2Q96C19 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFHD2Q96C19 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFHD2Q96C19 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFHD2Q96C19 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFHD2Q96C19 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFHD2Q96C19 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFHD2Q96C19 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFHD2Q96C19 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFHD2Q96C19 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFHD2Q96C19 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFHD2Q96C19 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
EFHD2Q96C19 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFHD2Q96C19 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFHD2Q96C19 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFHD2Q96C19 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFHD2Q96C19 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFHD2Q96C19 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFHD2Q96C19 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFHD2Q96C19 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
EFHD2Q96C19 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
EFHD2Q96C19 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFHD2Q96C19 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms