Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAVIN3Q969G5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms