Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATRIPQ8WXE1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATRIPQ8WXE1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms