Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRN4Q8WUT4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRN4Q8WUT4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRN4Q8WUT4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRN4Q8WUT4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRN4Q8WUT4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRN4Q8WUT4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRN4Q8WUT4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRN4Q8WUT4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRN4Q8WUT4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRN4Q8WUT4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRN4Q8WUT4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRN4Q8WUT4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRN4Q8WUT4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRN4Q8WUT4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRN4Q8WUT4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRN4Q8WUT4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRN4Q8WUT4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRN4Q8WUT4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRN4Q8WUT4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRN4Q8WUT4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRN4Q8WUT4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRN4Q8WUT4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRN4Q8WUT4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRN4Q8WUT4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRN4Q8WUT4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRN4Q8WUT4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRN4Q8WUT4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRN4Q8WUT4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRN4Q8WUT4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRN4Q8WUT4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRN4Q8WUT4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRN4Q8WUT4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms