Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HELQQ8TDG4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HELQQ8TDG4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HELQQ8TDG4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HELQQ8TDG4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HELQQ8TDG4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HELQQ8TDG4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HELQQ8TDG4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HELQQ8TDG4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HELQQ8TDG4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HELQQ8TDG4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HELQQ8TDG4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HELQQ8TDG4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HELQQ8TDG4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HELQQ8TDG4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HELQQ8TDG4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HELQQ8TDG4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HELQQ8TDG4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HELQQ8TDG4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms