Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF398Q8TD17 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF398Q8TD17 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms