Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCD1

C18orf32, UPF0729 protein C18orf32, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf32Q8TCD1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C18orf32Q8TCD1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C18orf32Q8TCD1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C18orf32Q8TCD1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C18orf32Q8TCD1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C18orf32Q8TCD1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C18orf32Q8TCD1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C18orf32Q8TCD1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C18orf32Q8TCD1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C18orf32Q8TCD1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C18orf32Q8TCD1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C18orf32Q8TCD1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C18orf32Q8TCD1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C18orf32Q8TCD1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C18orf32Q8TCD1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C18orf32Q8TCD1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C18orf32Q8TCD1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C18orf32Q8TCD1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C18orf32Q8TCD1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C18orf32Q8TCD1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C18orf32Q8TCD1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C18orf32Q8TCD1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C18orf32Q8TCD1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C18orf32Q8TCD1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C18orf32Q8TCD1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C18orf32Q8TCD1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C18orf32Q8TCD1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C18orf32Q8TCD1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C18orf32Q8TCD1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C18orf32Q8TCD1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C18orf32Q8TCD1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C18orf32Q8TCD1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C18orf32Q8TCD1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C18orf32Q8TCD1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C18orf32Q8TCD1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C18orf32Q8TCD1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C18orf32Q8TCD1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C18orf32Q8TCD1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf32Q8TCD1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf32Q8TCD1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf32Q8TCD1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf32Q8TCD1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf32Q8TCD1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf32Q8TCD1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf32Q8TCD1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms