Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHU2

CFAP61, Cilia- and flagella-associated protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP61Q8NHU2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CFAP61Q8NHU2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CFAP61Q8NHU2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
CFAP61Q8NHU2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP61Q8NHU2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP61Q8NHU2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP61Q8NHU2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP61Q8NHU2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP61Q8NHU2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP61Q8NHU2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP61Q8NHU2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP61Q8NHU2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP61Q8NHU2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP61Q8NHU2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP61Q8NHU2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP61Q8NHU2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP61Q8NHU2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP61Q8NHU2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CFAP61Q8NHU2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP61Q8NHU2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP61Q8NHU2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP61Q8NHU2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP61Q8NHU2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP61Q8NHU2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP61Q8NHU2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP61Q8NHU2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP61Q8NHU2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP61Q8NHU2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CFAP61Q8NHU2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CFAP61Q8NHU2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CFAP61Q8NHU2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CFAP61Q8NHU2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CFAP61Q8NHU2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CFAP61Q8NHU2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CFAP61Q8NHU2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CFAP61Q8NHU2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CFAP61Q8NHU2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CFAP61Q8NHU2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CFAP61Q8NHU2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CFAP61Q8NHU2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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