Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEY3

SPATA4, Spermatogenesis-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA4Q8NEY3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPATA4Q8NEY3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPATA4Q8NEY3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms