Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD53Q8N9V6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD53Q8N9V6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms