Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SFRP1Q8N474 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFRP1Q8N474 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms