Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTU1Q7Z7A3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms