Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTN6

STRADA, STE20-related kinase adapter protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADAQ7RTN6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRADAQ7RTN6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRADAQ7RTN6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms