Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q71RC1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q71RC1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q71RC1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q71RC1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q71RC1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q71RC1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q71RC1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Q71RC1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q71RC1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q71RC1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Q71RC1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q71RC1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q71RC1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q71RC1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q71RC1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q71RC1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q71RC1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q71RC1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q71RC1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q71RC1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q71RC1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q71RC1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q71RC1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q71RC1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q71RC1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q71RC1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q71RC1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q71RC1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q71RC1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q71RC1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q71RC1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q71RC1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q71RC1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q71RC1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q71RC1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q71RC1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q71RC1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Q71RC1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q71RC1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q71RC1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q71RC1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q71RC1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q71RC1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q71RC1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q71RC1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q71RC1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q71RC1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q71RC1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q71RC1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q71RC1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q71RC1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q71RC1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q71RC1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q71RC1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q71RC1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Q71RC1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q71RC1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q71RC1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q71RC1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q71RC1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Q71RC1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q71RC1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q71RC1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q71RC1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q71RC1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q71RC1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q71RC1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q71RC1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q71RC1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q71RC1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q71RC1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q71RC1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q71RC1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q71RC1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q71RC1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q71RC1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q71RC1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q71RC1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q71RC1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q71RC1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q71RC1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q71RC1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q71RC1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q71RC1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q71RC1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q71RC1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q71RC1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q71RC1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q71RC1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q71RC1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q71RC1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q71RC1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q71RC1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q71RC1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q71RC1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q71RC1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q71RC1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q71RC1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q71RC1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms