Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRIG3Q6UXM1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms